Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR4P51679 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR4P51679 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR4P51679 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR4P51679 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR4P51679 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR4P51679 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR4P51679 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR4P51679 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR4P51679 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR4P51679 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR4P51679 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR4P51679 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR4P51679 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR4P51679 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR4P51679 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR4P51679 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR4P51679 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR4P51679 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR4P51679 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR4P51679 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR4P51679 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR4P51679 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR4P51679 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR4P51679 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR4P51679 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR4P51679 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR4P51679 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR4P51679 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR4P51679 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR4P51679 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR4P51679 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR4P51679 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR4P51679 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR4P51679 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR4P51679 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR4P51679 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR4P51679 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR4P51679 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR4P51679 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR4P51679 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR4P51679 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR4P51679 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR4P51679 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR4P51679 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR4P51679 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR4P51679 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR4P51679 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR4P51679 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR4P51679 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR4P51679 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR4P51679 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR4P51679 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR4P51679 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR4P51679 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR4P51679 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR4P51679 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR4P51679 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR4P51679 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR4P51679 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR4P51679 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR4P51679 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR4P51679 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR4P51679 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR4P51679 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR4P51679 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR4P51679 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR4P51679 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR4P51679 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR4P51679 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR4P51679 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR4P51679 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR4P51679 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR4P51679 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR4P51679 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR4P51679 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR4P51679 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR4P51679 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR4P51679 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR4P51679 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR4P51679 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR4P51679 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR4P51679 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR4P51679 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR4P51679 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR4P51679 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR4P51679 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR4P51679 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR4P51679 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR4P51679 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms