Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC46.95■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.11
SMARCA2P51531 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC46.92■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC46.91■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
SMARCA2P51531 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC46.86■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC46.85■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.84■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.82■■■■■ 5.09
SMARCA2P51531 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.81■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC46.8■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC46.79■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC46.79■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC46.77■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC46.76■■■■■ 5.08
SMARCA2P51531 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC46.75■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC46.75■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC46.71■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.07
SMARCA2P51531 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.65■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.06
SMARCA2P51531 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC46.62■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC46.59■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
SMARCA2P51531 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
SMARCA2P51531 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC46.5■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
SMARCA2P51531 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms