Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
NUP153P49790 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
NUP153P49790 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NUP153P49790 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
NUP153P49790 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NUP153P49790 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
NUP153P49790 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
NUP153P49790 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
NUP153P49790 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
NUP153P49790 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
NUP153P49790 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NUP153P49790 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NUP153P49790 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NUP153P49790 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NUP153P49790 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NUP153P49790 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NUP153P49790 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
NUP153P49790 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
NUP153P49790 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
NUP153P49790 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NUP153P49790 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
NUP153P49790 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
NUP153P49790 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NUP153P49790 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NUP153P49790 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
NUP153P49790 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
NUP153P49790 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
NUP153P49790 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NUP153P49790 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NUP153P49790 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
NUP153P49790 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
NUP153P49790 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
NUP153P49790 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NUP153P49790 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
NUP153P49790 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NUP153P49790 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NUP153P49790 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NUP153P49790 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NUP153P49790 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NUP153P49790 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
NUP153P49790 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NUP153P49790 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NUP153P49790 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NUP153P49790 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
NUP153P49790 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
NUP153P49790 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NUP153P49790 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NUP153P49790 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NUP153P49790 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
NUP153P49790 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NUP153P49790 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NUP153P49790 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NUP153P49790 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
NUP153P49790 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NUP153P49790 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
NUP153P49790 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NUP153P49790 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
NUP153P49790 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
NUP153P49790 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
NUP153P49790 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NUP153P49790 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
NUP153P49790 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
NUP153P49790 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
NUP153P49790 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NUP153P49790 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NUP153P49790 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NUP153P49790 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NUP153P49790 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
NUP153P49790 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NUP153P49790 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NUP153P49790 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NUP153P49790 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
NUP153P49790 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NUP153P49790 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NUP153P49790 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
NUP153P49790 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NUP153P49790 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
NUP153P49790 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NUP153P49790 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
NUP153P49790 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
NUP153P49790 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NUP153P49790 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
NUP153P49790 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
NUP153P49790 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NUP153P49790 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
NUP153P49790 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
NUP153P49790 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NUP153P49790 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
NUP153P49790 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
NUP153P49790 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP153P49790 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP153P49790 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NUP153P49790 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NUP153P49790 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NUP153P49790 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
NUP153P49790 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NUP153P49790 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
NUP153P49790 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NUP153P49790 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
NUP153P49790 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms