Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-210ENST00000496816 2222 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 KIF7-202ENST00000445906 1375 ntTSL 1 (best)21.29■■□□□ 13e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.983e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZBTB7B-204ENST00000461530 658 ntTSL 421.12■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 420.89■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-212ENST00000596309 598 ntTSL 420.88■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-206ENST00000554224 1124 ntTSL 320.85■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.933e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 520.81■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 EPS8L2-203ENST00000524763 580 ntTSL 320.72■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SLC25A29-205ENST00000554060 674 ntTSL 220.65■□□□□ 0.93e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-208ENST00000476899 788 ntTSL 520.6■□□□□ 0.893e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 420.57■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OFD1-208ENST00000485052 685 ntTSL 320.49■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CACTIN-204ENST00000585942 2810 ntTSL 1 (best)20.44■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 320.29■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CENPA-204ENST00000460030 745 ntTSL 1 (best)20.26■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-206ENST00000471998 2182 ntTSL 220.25■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.833e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-204ENST00000422442 564 ntTSL 520.15■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HOOK2-224ENST00000593143 585 ntTSL 320.06■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SZRD1-205ENST00000472461 843 ntTSL 319.99■□□□□ 0.793e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 319.87■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-222ENST00000494302 2667 ntTSL 519.82■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 219.68■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PRDM2-209ENST00000491134 1100 ntTSL 319.67■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 REEP6-202ENST00000395479 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.4■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-209ENST00000431421 550 ntTSL 419.34■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-203ENST00000422066 604 ntTSL 419.34■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-225ENST00000636187 171 ntTSL 519.19■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 5314 ntTSL 219.16■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 GPATCH2L-205ENST00000554375 1791 ntTSL 519.06■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)19.04■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.633e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ANP32A-208ENST00000495420 707 ntTSL 218.68■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CPSF4-203ENST00000430038 735 ntTSL 518.61■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TMEM80-204ENST00000492023 2047 ntTSL 218.59■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 NUMBL-204ENST00000595741 559 ntTSL 418.59■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-207ENST00000420383 2817 ntTSL 218.55■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-219ENST00000627825 312 ntTSL 518.52■□□□□ 0.563e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-205ENST00000404127 3232 ntTSL 518.45■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ARHGAP4-219ENST00000470209 2889 ntTSL 518.43■□□□□ 0.543e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 IQSEC1-202ENST00000473088 545 ntTSL 418.35■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-215ENST00000533234 554 ntTSL 418.33■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 5751 ntTSL 218.19■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-209ENST00000417528 1023 ntTSL 318.17■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 HTRA2-204ENST00000462909 1294 ntTSL 318.16■□□□□ 0.53e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 OSBPL5-219ENST00000534491 2224 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 TBL1XR1-217ENST00000626672 568 ntTSL 418.1■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 ZBTB7B-205ENST00000483226 243 ntTSL 318.09■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 P4HA2-215ENST00000453286 819 ntTSL 518.09■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAB9A-201ENST00000243325 393 ntTSL 317.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 61.8
AARSP49588 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 61.8
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 228.5 ms