Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2AP49459 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2AP49459 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBE2AP49459 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200 ms