Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMAN1P49257 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LMAN1P49257 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMAN1P49257 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMAN1P49257 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN1P49257 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms