Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC1A6P48664 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A6P48664 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC1A6P48664 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC1A6P48664 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC1A6P48664 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC1A6P48664 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms