Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCP4P48539 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCP4P48539 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCP4P48539 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCP4P48539 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PCP4P48539 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCP4P48539 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCP4P48539 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCP4P48539 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCP4P48539 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCP4P48539 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PCP4P48539 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCP4P48539 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCP4P48539 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCP4P48539 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCP4P48539 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PCP4P48539 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCP4P48539 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCP4P48539 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCP4P48539 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCP4P48539 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCP4P48539 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCP4P48539 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCP4P48539 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCP4P48539 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCP4P48539 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCP4P48539 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCP4P48539 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCP4P48539 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCP4P48539 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCP4P48539 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCP4P48539 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCP4P48539 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCP4P48539 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCP4P48539 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCP4P48539 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCP4P48539 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCP4P48539 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCP4P48539 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCP4P48539 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCP4P48539 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCP4P48539 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCP4P48539 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCP4P48539 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCP4P48539 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCP4P48539 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCP4P48539 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCP4P48539 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCP4P48539 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCP4P48539 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCP4P48539 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCP4P48539 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCP4P48539 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCP4P48539 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCP4P48539 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCP4P48539 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCP4P48539 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCP4P48539 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCP4P48539 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCP4P48539 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCP4P48539 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCP4P48539 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCP4P48539 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PCP4P48539 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PCP4P48539 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCP4P48539 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCP4P48539 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCP4P48539 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCP4P48539 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PCP4P48539 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCP4P48539 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCP4P48539 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PCP4P48539 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCP4P48539 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PCP4P48539 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCP4P48539 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCP4P48539 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PCP4P48539 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCP4P48539 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCP4P48539 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCP4P48539 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PCP4P48539 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCP4P48539 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCP4P48539 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PCP4P48539 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCP4P48539 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCP4P48539 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCP4P48539 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCP4P48539 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCP4P48539 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCP4P48539 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PCP4P48539 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms