Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
IQGAP1P46940 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
IQGAP1P46940 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
IQGAP1P46940 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
IQGAP1P46940 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
IQGAP1P46940 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
IQGAP1P46940 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
IQGAP1P46940 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
IQGAP1P46940 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms