Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP2P46087 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP2P46087 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NOP2P46087 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP2P46087 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP2P46087 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP2P46087 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP2P46087 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NOP2P46087 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP2P46087 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NOP2P46087 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP2P46087 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP2P46087 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP2P46087 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP2P46087 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NOP2P46087 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NOP2P46087 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NOP2P46087 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NOP2P46087 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NOP2P46087 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP2P46087 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP2P46087 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP2P46087 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NOP2P46087 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP2P46087 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP2P46087 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP2P46087 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NOP2P46087 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP2P46087 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NOP2P46087 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP2P46087 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP2P46087 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP2P46087 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NOP2P46087 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NOP2P46087 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP2P46087 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP2P46087 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP2P46087 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP2P46087 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NOP2P46087 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NOP2P46087 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP2P46087 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP2P46087 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP2P46087 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NOP2P46087 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP2P46087 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP2P46087 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP2P46087 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP2P46087 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NOP2P46087 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP2P46087 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP2P46087 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NOP2P46087 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP2P46087 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP2P46087 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NOP2P46087 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP2P46087 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP2P46087 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NOP2P46087 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP2P46087 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP2P46087 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP2P46087 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP2P46087 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP2P46087 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP2P46087 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP2P46087 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NOP2P46087 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP2P46087 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP2P46087 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP2P46087 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP2P46087 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NOP2P46087 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NOP2P46087 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP2P46087 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NOP2P46087 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP2P46087 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP2P46087 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP2P46087 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NOP2P46087 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP2P46087 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP2P46087 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NOP2P46087 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP2P46087 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP2P46087 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP2P46087 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP2P46087 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NOP2P46087 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NOP2P46087 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1097.8 ms