Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIK3CAP42336 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PIK3CAP42336 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PIK3CAP42336 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PIK3CAP42336 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CAP42336 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CAP42336 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PIK3CAP42336 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PIK3CAP42336 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CAP42336 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CAP42336 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CAP42336 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PIK3CAP42336 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3CAP42336 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PIK3CAP42336 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3CAP42336 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3CAP42336 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PIK3CAP42336 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PIK3CAP42336 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms