Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL1P40616 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL1P40616 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL1P40616 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL1P40616 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARL1P40616 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARL1P40616 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARL1P40616 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL1P40616 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL1P40616 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL1P40616 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL1P40616 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL1P40616 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARL1P40616 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL1P40616 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL1P40616 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL1P40616 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL1P40616 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL1P40616 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL1P40616 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARL1P40616 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL1P40616 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL1P40616 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL1P40616 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL1P40616 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL1P40616 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARL1P40616 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ARL1P40616 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARL1P40616 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARL1P40616 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL1P40616 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL1P40616 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL1P40616 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL1P40616 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARL1P40616 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL1P40616 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL1P40616 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL1P40616 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL1P40616 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARL1P40616 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL1P40616 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL1P40616 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL1P40616 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARL1P40616 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL1P40616 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL1P40616 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL1P40616 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL1P40616 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL1P40616 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARL1P40616 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARL1P40616 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARL1P40616 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL1P40616 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL1P40616 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARL1P40616 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL1P40616 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL1P40616 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL1P40616 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL1P40616 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL1P40616 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARL1P40616 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL1P40616 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL1P40616 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL1P40616 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL1P40616 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL1P40616 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL1P40616 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARL1P40616 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL1P40616 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARL1P40616 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARL1P40616 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARL1P40616 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL1P40616 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL1P40616 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL1P40616 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL1P40616 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL1P40616 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL1P40616 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ARL1P40616 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL1P40616 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL1P40616 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL1P40616 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL1P40616 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL1P40616 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARL1P40616 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL1P40616 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL1P40616 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL1P40616 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL1P40616 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL1P40616 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL1P40616 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARL1P40616 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL1P40616 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL1P40616 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL1P40616 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARL1P40616 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL1P40616 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL1P40616 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARL1P40616 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARL1P40616 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms