Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FEN1P39748 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FEN1P39748 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FEN1P39748 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FEN1P39748 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FEN1P39748 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FEN1P39748 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FEN1P39748 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FEN1P39748 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FEN1P39748 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FEN1P39748 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FEN1P39748 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FEN1P39748 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FEN1P39748 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FEN1P39748 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FEN1P39748 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FEN1P39748 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FEN1P39748 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FEN1P39748 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FEN1P39748 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FEN1P39748 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FEN1P39748 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FEN1P39748 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FEN1P39748 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FEN1P39748 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FEN1P39748 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FEN1P39748 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FEN1P39748 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FEN1P39748 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FEN1P39748 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FEN1P39748 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FEN1P39748 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FEN1P39748 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FEN1P39748 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FEN1P39748 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FEN1P39748 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FEN1P39748 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FEN1P39748 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FEN1P39748 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FEN1P39748 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FEN1P39748 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FEN1P39748 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FEN1P39748 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FEN1P39748 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FEN1P39748 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FEN1P39748 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FEN1P39748 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FEN1P39748 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FEN1P39748 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FEN1P39748 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FEN1P39748 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FEN1P39748 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FEN1P39748 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FEN1P39748 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FEN1P39748 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FEN1P39748 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FEN1P39748 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FEN1P39748 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FEN1P39748 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FEN1P39748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FEN1P39748 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FEN1P39748 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FEN1P39748 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FEN1P39748 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FEN1P39748 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FEN1P39748 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FEN1P39748 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FEN1P39748 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FEN1P39748 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FEN1P39748 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FEN1P39748 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FEN1P39748 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FEN1P39748 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FEN1P39748 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FEN1P39748 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FEN1P39748 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FEN1P39748 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FEN1P39748 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms