Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC1P35052 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC1P35052 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC1P35052 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC1P35052 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC1P35052 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPC1P35052 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC1P35052 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPC1P35052 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC1P35052 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GPC1P35052 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC1P35052 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC1P35052 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC1P35052 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GPC1P35052 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPC1P35052 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC1P35052 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC1P35052 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPC1P35052 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC1P35052 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC1P35052 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC1P35052 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPC1P35052 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC1P35052 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC1P35052 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC1P35052 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC1P35052 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC1P35052 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPC1P35052 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC1P35052 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC1P35052 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC1P35052 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC1P35052 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC1P35052 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC1P35052 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC1P35052 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC1P35052 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC1P35052 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC1P35052 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC1P35052 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC1P35052 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC1P35052 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC1P35052 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC1P35052 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC1P35052 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC1P35052 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC1P35052 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC1P35052 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC1P35052 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC1P35052 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC1P35052 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC1P35052 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC1P35052 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC1P35052 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC1P35052 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC1P35052 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC1P35052 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC1P35052 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC1P35052 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC1P35052 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC1P35052 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC1P35052 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC1P35052 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC1P35052 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC1P35052 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC1P35052 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC1P35052 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC1P35052 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC1P35052 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC1P35052 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC1P35052 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC1P35052 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC1P35052 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC1P35052 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC1P35052 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC1P35052 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC1P35052 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GPC1P35052 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC1P35052 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC1P35052 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC1P35052 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC1P35052 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GPC1P35052 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GPC1P35052 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC1P35052 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GPC1P35052 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC1P35052 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC1P35052 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC1P35052 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC1P35052 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC1P35052 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC1P35052 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GPC1P35052 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC1P35052 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC1P35052 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GPC1P35052 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC1P35052 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC1P35052 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GPC1P35052 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GPC1P35052 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms