Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH5P33151 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH5P33151 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH5P33151 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH5P33151 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH5P33151 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH5P33151 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH5P33151 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH5P33151 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH5P33151 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH5P33151 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH5P33151 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH5P33151 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH5P33151 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH5P33151 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH5P33151 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH5P33151 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH5P33151 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH5P33151 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH5P33151 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH5P33151 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH5P33151 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH5P33151 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH5P33151 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH5P33151 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH5P33151 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH5P33151 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH5P33151 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH5P33151 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH5P33151 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH5P33151 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH5P33151 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH5P33151 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH5P33151 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH5P33151 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH5P33151 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH5P33151 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH5P33151 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH5P33151 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH5P33151 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH5P33151 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH5P33151 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH5P33151 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH5P33151 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH5P33151 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH5P33151 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH5P33151 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH5P33151 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH5P33151 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH5P33151 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH5P33151 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH5P33151 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH5P33151 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH5P33151 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH5P33151 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH5P33151 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH5P33151 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH5P33151 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH5P33151 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH5P33151 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH5P33151 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH5P33151 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH5P33151 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH5P33151 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH5P33151 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH5P33151 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH5P33151 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH5P33151 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH5P33151 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH5P33151 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH5P33151 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH5P33151 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH5P33151 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH5P33151 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDH5P33151 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH5P33151 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH5P33151 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH5P33151 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH5P33151 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH5P33151 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH5P33151 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH5P33151 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH5P33151 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH5P33151 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH5P33151 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH5P33151 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH5P33151 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH5P33151 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH5P33151 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH5P33151 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDH5P33151 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDH5P33151 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDH5P33151 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH5P33151 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH5P33151 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDH5P33151 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH5P33151 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDH5P33151 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH5P33151 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDH5P33151 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms