Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACSL1P33121 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACSL1P33121 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ACSL1P33121 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACSL1P33121 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACSL1P33121 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL1P33121 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACSL1P33121 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACSL1P33121 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms