Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCKARP32238 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCKARP32238 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCKARP32238 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCKARP32238 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCKARP32238 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCKARP32238 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCKARP32238 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKARP32238 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKARP32238 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKARP32238 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKARP32238 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCKARP32238 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCKARP32238 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCKARP32238 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCKARP32238 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCKARP32238 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKARP32238 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKARP32238 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKARP32238 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKARP32238 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCKARP32238 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKARP32238 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKARP32238 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCKARP32238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKARP32238 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKARP32238 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCKARP32238 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKARP32238 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKARP32238 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKARP32238 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKARP32238 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCKARP32238 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKARP32238 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCKARP32238 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCKARP32238 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKARP32238 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCKARP32238 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKARP32238 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKARP32238 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKARP32238 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKARP32238 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKARP32238 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCKARP32238 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKARP32238 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKARP32238 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKARP32238 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKARP32238 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKARP32238 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKARP32238 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCKARP32238 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKARP32238 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKARP32238 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKARP32238 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKARP32238 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCKARP32238 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCKARP32238 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCKARP32238 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCKARP32238 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCKARP32238 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKARP32238 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKARP32238 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKARP32238 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCKARP32238 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCKARP32238 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCKARP32238 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCKARP32238 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKARP32238 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKARP32238 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKARP32238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKARP32238 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKARP32238 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKARP32238 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCKARP32238 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKARP32238 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKARP32238 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKARP32238 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKARP32238 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKARP32238 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCKARP32238 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKARP32238 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKARP32238 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKARP32238 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKARP32238 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKARP32238 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCKARP32238 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKARP32238 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKARP32238 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKARP32238 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCKARP32238 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms