Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC13P31276 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC13P31276 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXC13P31276 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXC13P31276 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXC13P31276 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms