Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSPOP30536 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSPOP30536 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSPOP30536 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSPOP30536 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSPOP30536 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSPOP30536 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSPOP30536 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSPOP30536 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSPOP30536 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSPOP30536 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSPOP30536 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSPOP30536 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSPOP30536 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSPOP30536 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TSPOP30536 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TSPOP30536 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPOP30536 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPOP30536 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPOP30536 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPOP30536 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPOP30536 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPOP30536 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TSPOP30536 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TSPOP30536 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPOP30536 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPOP30536 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPOP30536 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPOP30536 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TSPOP30536 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPOP30536 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPOP30536 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPOP30536 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TSPOP30536 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPOP30536 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPOP30536 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPOP30536 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPOP30536 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPOP30536 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPOP30536 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPOP30536 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TSPOP30536 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPOP30536 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPOP30536 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPOP30536 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPOP30536 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TSPOP30536 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPOP30536 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPOP30536 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPOP30536 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPOP30536 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TSPOP30536 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPOP30536 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPOP30536 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPOP30536 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TSPOP30536 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPOP30536 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPOP30536 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPOP30536 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPOP30536 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPOP30536 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TSPOP30536 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPOP30536 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPOP30536 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPOP30536 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPOP30536 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPOP30536 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TSPOP30536 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPOP30536 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPOP30536 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPOP30536 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPOP30536 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPOP30536 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TSPOP30536 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPOP30536 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPOP30536 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TSPOP30536 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPOP30536 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPOP30536 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPOP30536 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPOP30536 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPOP30536 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPOP30536 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPOP30536 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPOP30536 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPOP30536 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPOP30536 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPOP30536 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPOP30536 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPOP30536 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPOP30536 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPOP30536 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms