Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP29P30040 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP29P30040 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERP29P30040 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP29P30040 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP29P30040 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERP29P30040 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP29P30040 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP29P30040 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP29P30040 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP29P30040 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERP29P30040 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP29P30040 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP29P30040 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERP29P30040 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP29P30040 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP29P30040 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP29P30040 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP29P30040 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP29P30040 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP29P30040 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERP29P30040 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERP29P30040 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERP29P30040 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERP29P30040 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERP29P30040 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP29P30040 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP29P30040 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERP29P30040 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP29P30040 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP29P30040 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP29P30040 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP29P30040 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP29P30040 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP29P30040 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERP29P30040 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP29P30040 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP29P30040 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP29P30040 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP29P30040 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP29P30040 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP29P30040 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP29P30040 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP29P30040 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP29P30040 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP29P30040 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP29P30040 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP29P30040 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP29P30040 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP29P30040 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP29P30040 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP29P30040 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP29P30040 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP29P30040 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP29P30040 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP29P30040 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP29P30040 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP29P30040 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP29P30040 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP29P30040 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP29P30040 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP29P30040 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP29P30040 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP29P30040 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP29P30040 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP29P30040 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP29P30040 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP29P30040 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP29P30040 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP29P30040 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP29P30040 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP29P30040 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP29P30040 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP29P30040 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP29P30040 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP29P30040 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP29P30040 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP29P30040 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP29P30040 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP29P30040 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP29P30040 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP29P30040 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP29P30040 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP29P30040 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP29P30040 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP29P30040 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP29P30040 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP29P30040 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERP29P30040 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP29P30040 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERP29P30040 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERP29P30040 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERP29P30040 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP29P30040 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP29P30040 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP29P30040 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP29P30040 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP29P30040 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERP29P30040 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP29P30040 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms