Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD10P28358 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD10P28358 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD10P28358 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HOXD10P28358 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXD10P28358 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms