Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLNP26678 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLNP26678 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLNP26678 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLNP26678 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLNP26678 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLNP26678 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLNP26678 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLNP26678 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLNP26678 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLNP26678 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLNP26678 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLNP26678 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PLNP26678 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PLNP26678 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLNP26678 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLNP26678 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLNP26678 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLNP26678 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLNP26678 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PLNP26678 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLNP26678 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLNP26678 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLNP26678 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLNP26678 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLNP26678 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLNP26678 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLNP26678 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLNP26678 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLNP26678 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLNP26678 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLNP26678 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLNP26678 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLNP26678 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLNP26678 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLNP26678 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLNP26678 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLNP26678 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLNP26678 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLNP26678 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLNP26678 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLNP26678 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLNP26678 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLNP26678 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLNP26678 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLNP26678 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLNP26678 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLNP26678 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLNP26678 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLNP26678 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLNP26678 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PLNP26678 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLNP26678 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLNP26678 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLNP26678 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLNP26678 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PLNP26678 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLNP26678 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLNP26678 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLNP26678 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLNP26678 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLNP26678 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLNP26678 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLNP26678 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLNP26678 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLNP26678 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLNP26678 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLNP26678 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLNP26678 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLNP26678 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLNP26678 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLNP26678 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLNP26678 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLNP26678 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLNP26678 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLNP26678 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms