Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VARSP26640 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VARSP26640 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VARSP26640 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VARSP26640 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VARSP26640 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VARSP26640 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VARSP26640 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VARSP26640 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VARSP26640 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VARSP26640 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VARSP26640 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VARSP26640 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VARSP26640 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VARSP26640 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VARSP26640 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VARSP26640 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VARSP26640 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VARSP26640 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VARSP26640 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VARSP26640 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VARSP26640 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VARSP26640 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VARSP26640 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VARSP26640 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VARSP26640 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VARSP26640 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VARSP26640 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VARSP26640 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VARSP26640 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VARSP26640 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VARSP26640 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VARSP26640 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VARSP26640 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VARSP26640 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VARSP26640 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VARSP26640 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VARSP26640 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VARSP26640 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VARSP26640 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VARSP26640 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VARSP26640 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VARSP26640 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VARSP26640 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VARSP26640 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VARSP26640 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VARSP26640 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VARSP26640 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VARSP26640 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VARSP26640 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VARSP26640 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VARSP26640 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VARSP26640 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VARSP26640 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VARSP26640 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VARSP26640 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VARSP26640 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VARSP26640 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VARSP26640 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VARSP26640 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VARSP26640 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VARSP26640 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VARSP26640 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VARSP26640 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VARSP26640 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VARSP26640 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VARSP26640 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VARSP26640 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VARSP26640 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VARSP26640 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VARSP26640 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VARSP26640 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VARSP26640 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VARSP26640 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VARSP26640 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VARSP26640 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VARSP26640 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VARSP26640 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VARSP26640 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VARSP26640 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VARSP26640 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VARSP26640 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VARSP26640 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VARSP26640 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VARSP26640 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VARSP26640 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VARSP26640 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VARSP26640 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VARSP26640 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VARSP26640 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VARSP26640 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VARSP26640 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VARSP26640 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VARSP26640 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VARSP26640 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VARSP26640 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VARSP26640 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VARSP26640 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VARSP26640 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VARSP26640 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms