Protein–RNA interactions for Protein: P26012

ITGB8, Integrin beta-8, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB8P26012 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB8P26012 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGB8P26012 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB8P26012 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB8P26012 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITGB8P26012 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms