Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA3P26006 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGA3P26006 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA3P26006 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ITGA3P26006 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA3P26006 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms