Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSSP25774 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSSP25774 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSSP25774 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSSP25774 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSSP25774 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSSP25774 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSSP25774 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSSP25774 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSSP25774 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSSP25774 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSSP25774 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSSP25774 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSSP25774 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSSP25774 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CTSSP25774 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSSP25774 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSSP25774 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSSP25774 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSSP25774 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSSP25774 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSSP25774 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSSP25774 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSSP25774 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSSP25774 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSSP25774 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSSP25774 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSSP25774 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSSP25774 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSSP25774 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSSP25774 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSSP25774 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSSP25774 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSSP25774 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSSP25774 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSSP25774 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSSP25774 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSSP25774 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSSP25774 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSSP25774 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSSP25774 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSSP25774 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSSP25774 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSSP25774 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSSP25774 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSSP25774 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSSP25774 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSSP25774 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSSP25774 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSSP25774 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSSP25774 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSSP25774 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSSP25774 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSSP25774 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSSP25774 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSSP25774 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSSP25774 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSSP25774 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSSP25774 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSSP25774 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSSP25774 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSSP25774 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSSP25774 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSSP25774 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSSP25774 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSSP25774 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSSP25774 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSSP25774 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSSP25774 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSSP25774 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSSP25774 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSSP25774 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSSP25774 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSSP25774 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSSP25774 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSSP25774 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSSP25774 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSSP25774 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSSP25774 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSSP25774 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSSP25774 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSSP25774 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSSP25774 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSSP25774 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSSP25774 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSSP25774 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSSP25774 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSSP25774 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSSP25774 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSSP25774 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.9 ms