Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA1P25391 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LAMA1P25391 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LAMA1P25391 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LAMA1P25391 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA1P25391 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA1P25391 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms