Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCND1P24385 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND1P24385 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND1P24385 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND1P24385 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND1P24385 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCND1P24385 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND1P24385 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND1P24385 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCND1P24385 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND1P24385 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND1P24385 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCND1P24385 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND1P24385 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND1P24385 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND1P24385 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND1P24385 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND1P24385 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND1P24385 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCND1P24385 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCND1P24385 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCND1P24385 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCND1P24385 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCND1P24385 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCND1P24385 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCND1P24385 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND1P24385 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND1P24385 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCND1P24385 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND1P24385 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCND1P24385 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND1P24385 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCND1P24385 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCND1P24385 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCND1P24385 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCND1P24385 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCND1P24385 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND1P24385 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCND1P24385 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCND1P24385 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCND1P24385 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCND1P24385 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCND1P24385 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCND1P24385 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND1P24385 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND1P24385 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND1P24385 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND1P24385 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND1P24385 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND1P24385 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND1P24385 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCND1P24385 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND1P24385 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND1P24385 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND1P24385 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND1P24385 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCND1P24385 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCND1P24385 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCND1P24385 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCND1P24385 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCND1P24385 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCND1P24385 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCND1P24385 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCND1P24385 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND1P24385 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCND1P24385 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND1P24385 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND1P24385 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND1P24385 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCND1P24385 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND1P24385 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND1P24385 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND1P24385 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND1P24385 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND1P24385 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND1P24385 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND1P24385 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCND1P24385 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND1P24385 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND1P24385 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND1P24385 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCND1P24385 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND1P24385 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND1P24385 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND1P24385 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND1P24385 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND1P24385 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCND1P24385 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND1P24385 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND1P24385 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCND1P24385 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms