Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PTPRGP23470 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PTPRGP23470 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PTPRGP23470 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
PTPRGP23470 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
PTPRGP23470 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PTPRGP23470 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
PTPRGP23470 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
PTPRGP23470 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PTPRGP23470 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PTPRGP23470 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
PTPRGP23470 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PTPRGP23470 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PTPRGP23470 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms