Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
AMPD1P23109 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AMPD1P23109 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AMPD1P23109 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AMPD1P23109 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AMPD1P23109 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms