Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCMT1P22061 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCMT1P22061 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCMT1P22061 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCMT1P22061 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms