Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTNP21246 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTNP21246 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTNP21246 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTNP21246 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTNP21246 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTNP21246 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTNP21246 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTNP21246 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTNP21246 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTNP21246 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTNP21246 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTNP21246 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTNP21246 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTNP21246 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTNP21246 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTNP21246 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTNP21246 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTNP21246 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTNP21246 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTNP21246 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTNP21246 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTNP21246 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTNP21246 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTNP21246 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTNP21246 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTNP21246 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTNP21246 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTNP21246 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTNP21246 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTNP21246 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTNP21246 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTNP21246 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTNP21246 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTNP21246 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTNP21246 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTNP21246 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTNP21246 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTNP21246 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTNP21246 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTNP21246 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTNP21246 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTNP21246 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTNP21246 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTNP21246 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTNP21246 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTNP21246 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTNP21246 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTNP21246 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTNP21246 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTNP21246 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTNP21246 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTNP21246 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTNP21246 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTNP21246 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTNP21246 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTNP21246 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTNP21246 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTNP21246 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTNP21246 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTNP21246 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTNP21246 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTNP21246 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTNP21246 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTNP21246 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTNP21246 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTNP21246 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTNP21246 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTNP21246 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTNP21246 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTNP21246 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTNP21246 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTNP21246 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTNP21246 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTNP21246 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTNP21246 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTNP21246 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTNP21246 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTNP21246 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTNP21246 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTNP21246 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTNP21246 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTNP21246 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTNP21246 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTNP21246 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTNP21246 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTNP21246 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTNP21246 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTNP21246 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTNP21246 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTNP21246 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTNP21246 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms