Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBPP20226 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TBPP20226 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBPP20226 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBPP20226 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBPP20226 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBPP20226 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TBPP20226 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBPP20226 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBPP20226 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBPP20226 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TBPP20226 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBPP20226 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBPP20226 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TBPP20226 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBPP20226 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBPP20226 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBPP20226 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TBPP20226 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TBPP20226 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBPP20226 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBPP20226 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBPP20226 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TBPP20226 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBPP20226 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBPP20226 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBPP20226 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TBPP20226 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TBPP20226 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBPP20226 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBPP20226 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBPP20226 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBPP20226 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBPP20226 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TBPP20226 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TBPP20226 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBPP20226 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBPP20226 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBPP20226 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBPP20226 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBPP20226 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBPP20226 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBPP20226 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBPP20226 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBPP20226 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBPP20226 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBPP20226 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBPP20226 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBPP20226 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBPP20226 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBPP20226 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBPP20226 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBPP20226 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBPP20226 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBPP20226 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBPP20226 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBPP20226 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBPP20226 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBPP20226 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBPP20226 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBPP20226 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBPP20226 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBPP20226 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBPP20226 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBPP20226 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBPP20226 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBPP20226 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBPP20226 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBPP20226 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBPP20226 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBPP20226 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TBPP20226 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBPP20226 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBPP20226 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBPP20226 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBPP20226 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBPP20226 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBPP20226 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBPP20226 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBPP20226 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBPP20226 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBPP20226 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBPP20226 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TBPP20226 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBPP20226 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBPP20226 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TBPP20226 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBPP20226 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBPP20226 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBPP20226 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBPP20226 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBPP20226 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBPP20226 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBPP20226 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBPP20226 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBPP20226 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBPP20226 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBPP20226 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBPP20226 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBPP20226 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms