Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT4P19013 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT4P19013 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT4P19013 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT4P19013 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT4P19013 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT4P19013 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT4P19013 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT4P19013 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT4P19013 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT4P19013 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT4P19013 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT4P19013 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT4P19013 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT4P19013 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT4P19013 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT4P19013 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT4P19013 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT4P19013 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT4P19013 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT4P19013 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT4P19013 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT4P19013 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT4P19013 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT4P19013 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT4P19013 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT4P19013 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT4P19013 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT4P19013 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT4P19013 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT4P19013 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT4P19013 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT4P19013 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT4P19013 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT4P19013 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT4P19013 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT4P19013 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT4P19013 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT4P19013 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT4P19013 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT4P19013 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT4P19013 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT4P19013 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT4P19013 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT4P19013 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT4P19013 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT4P19013 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT4P19013 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT4P19013 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT4P19013 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT4P19013 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT4P19013 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT4P19013 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT4P19013 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT4P19013 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT4P19013 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT4P19013 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT4P19013 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT4P19013 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT4P19013 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT4P19013 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT4P19013 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT4P19013 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT4P19013 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT4P19013 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT4P19013 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT4P19013 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT4P19013 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT4P19013 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT4P19013 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT4P19013 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT4P19013 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT4P19013 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT4P19013 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT4P19013 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT4P19013 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT4P19013 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT4P19013 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT4P19013 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT4P19013 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT4P19013 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT4P19013 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT4P19013 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT4P19013 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT4P19013 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT4P19013 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT4P19013 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT4P19013 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT4P19013 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT4P19013 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT4P19013 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms