Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NELFEP18615 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFEP18615 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFEP18615 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NELFEP18615 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFEP18615 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFEP18615 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFEP18615 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NELFEP18615 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFEP18615 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFEP18615 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NELFEP18615 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFEP18615 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFEP18615 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFEP18615 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFEP18615 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NELFEP18615 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFEP18615 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFEP18615 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFEP18615 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NELFEP18615 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NELFEP18615 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFEP18615 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFEP18615 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NELFEP18615 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NELFEP18615 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NELFEP18615 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NELFEP18615 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NELFEP18615 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NELFEP18615 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFEP18615 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFEP18615 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NELFEP18615 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFEP18615 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFEP18615 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NELFEP18615 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NELFEP18615 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFEP18615 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFEP18615 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFEP18615 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFEP18615 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFEP18615 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFEP18615 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NELFEP18615 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NELFEP18615 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFEP18615 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFEP18615 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFEP18615 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NELFEP18615 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFEP18615 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFEP18615 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFEP18615 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFEP18615 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFEP18615 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFEP18615 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NELFEP18615 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NELFEP18615 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NELFEP18615 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFEP18615 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFEP18615 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFEP18615 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NELFEP18615 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFEP18615 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFEP18615 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFEP18615 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFEP18615 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NELFEP18615 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFEP18615 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFEP18615 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFEP18615 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NELFEP18615 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NELFEP18615 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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