Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOT1P17174 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOT1P17174 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOT1P17174 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOT1P17174 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOT1P17174 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOT1P17174 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOT1P17174 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOT1P17174 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOT1P17174 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOT1P17174 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOT1P17174 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOT1P17174 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOT1P17174 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOT1P17174 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOT1P17174 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOT1P17174 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOT1P17174 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOT1P17174 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOT1P17174 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GOT1P17174 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GOT1P17174 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOT1P17174 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GOT1P17174 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOT1P17174 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOT1P17174 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOT1P17174 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOT1P17174 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GOT1P17174 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GOT1P17174 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GOT1P17174 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOT1P17174 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOT1P17174 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOT1P17174 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOT1P17174 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOT1P17174 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOT1P17174 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOT1P17174 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOT1P17174 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOT1P17174 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOT1P17174 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GOT1P17174 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GOT1P17174 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOT1P17174 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GOT1P17174 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOT1P17174 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOT1P17174 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GOT1P17174 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOT1P17174 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOT1P17174 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOT1P17174 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOT1P17174 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOT1P17174 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOT1P17174 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOT1P17174 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOT1P17174 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOT1P17174 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOT1P17174 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOT1P17174 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOT1P17174 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOT1P17174 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOT1P17174 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOT1P17174 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOT1P17174 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOT1P17174 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOT1P17174 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOT1P17174 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOT1P17174 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOT1P17174 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOT1P17174 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOT1P17174 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOT1P17174 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOT1P17174 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOT1P17174 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOT1P17174 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOT1P17174 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOT1P17174 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOT1P17174 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOT1P17174 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOT1P17174 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOT1P17174 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOT1P17174 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOT1P17174 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOT1P17174 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOT1P17174 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOT1P17174 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOT1P17174 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOT1P17174 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOT1P17174 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOT1P17174 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GOT1P17174 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOT1P17174 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOT1P17174 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOT1P17174 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOT1P17174 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOT1P17174 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOT1P17174 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOT1P17174 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOT1P17174 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOT1P17174 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms