Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SELPP16109 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SELPP16109 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SELPP16109 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SELPP16109 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SELPP16109 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SELPP16109 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SELPP16109 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SELPP16109 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SELPP16109 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SELPP16109 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SELPP16109 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SELPP16109 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SELPP16109 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SELPP16109 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELPP16109 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELPP16109 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELPP16109 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELPP16109 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELPP16109 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELPP16109 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SELPP16109 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELPP16109 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELPP16109 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SELPP16109 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELPP16109 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELPP16109 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELPP16109 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELPP16109 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SELPP16109 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SELPP16109 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SELPP16109 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SELPP16109 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SELPP16109 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SELPP16109 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SELPP16109 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SELPP16109 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SELPP16109 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SELPP16109 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SELPP16109 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SELPP16109 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SELPP16109 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SELPP16109 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SELPP16109 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SELPP16109 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SELPP16109 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SELPP16109 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SELPP16109 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SELPP16109 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SELPP16109 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELPP16109 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELPP16109 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SELPP16109 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SELPP16109 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SELPP16109 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SELPP16109 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SELPP16109 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SELPP16109 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SELPP16109 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SELPP16109 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SELPP16109 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SELPP16109 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SELPP16109 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SELPP16109 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SELPP16109 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELPP16109 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELPP16109 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SELPP16109 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SELPP16109 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SELPP16109 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SELPP16109 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SELPP16109 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SELPP16109 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SELPP16109 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SELPP16109 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SELPP16109 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SELPP16109 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SELPP16109 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SELPP16109 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELPP16109 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELPP16109 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SELPP16109 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELPP16109 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELPP16109 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SELPP16109 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELPP16109 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELPP16109 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELPP16109 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SELPP16109 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELPP16109 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SELPP16109 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELPP16109 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELPP16109 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELPP16109 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SELPP16109 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELPP16109 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELPP16109 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELPP16109 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELPP16109 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SELPP16109 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms