Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB3P14651 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB3P14651 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB3P14651 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXB3P14651 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms