Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM27P14373 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM27P14373 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TRIM27P14373 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM27P14373 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM27P14373 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRIM27P14373 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TRIM27P14373 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM27P14373 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms