Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DOBP13765 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HLA-DOBP13765 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-DOBP13765 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-DOBP13765 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms