Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT5P13647 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT5P13647 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT5P13647 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT5P13647 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT5P13647 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT5P13647 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT5P13647 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT5P13647 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT5P13647 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT5P13647 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT5P13647 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT5P13647 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT5P13647 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT5P13647 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT5P13647 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT5P13647 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT5P13647 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT5P13647 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT5P13647 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT5P13647 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT5P13647 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT5P13647 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT5P13647 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT5P13647 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT5P13647 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT5P13647 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT5P13647 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT5P13647 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT5P13647 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT5P13647 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT5P13647 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT5P13647 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT5P13647 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT5P13647 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT5P13647 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT5P13647 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT5P13647 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT5P13647 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT5P13647 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT5P13647 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT5P13647 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT5P13647 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT5P13647 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT5P13647 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT5P13647 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT5P13647 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT5P13647 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT5P13647 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT5P13647 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT5P13647 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT5P13647 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT5P13647 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT5P13647 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT5P13647 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT5P13647 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT5P13647 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT5P13647 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT5P13647 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT5P13647 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT5P13647 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT5P13647 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT5P13647 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT5P13647 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT5P13647 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT5P13647 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT5P13647 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT5P13647 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT5P13647 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT5P13647 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT5P13647 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT5P13647 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT5P13647 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT5P13647 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT5P13647 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT5P13647 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT5P13647 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT5P13647 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT5P13647 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT5P13647 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT5P13647 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT5P13647 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT5P13647 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT5P13647 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT5P13647 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT5P13647 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT5P13647 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT5P13647 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT5P13647 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT5P13647 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KRT5P13647 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT5P13647 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT5P13647 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT5P13647 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT5P13647 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT5P13647 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT5P13647 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT5P13647 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT5P13647 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT5P13647 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms