Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CFTRP13569 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CFTRP13569 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CFTRP13569 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CFTRP13569 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CFTRP13569 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CFTRP13569 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CFTRP13569 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CFTRP13569 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
CFTRP13569 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CFTRP13569 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CFTRP13569 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CFTRP13569 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CFTRP13569 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
CFTRP13569 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
CFTRP13569 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
CFTRP13569 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC45.26■■■■■ 4.84
CFTRP13569 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CFTRP13569 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CFTRP13569 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CFTRP13569 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CFTRP13569 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
CFTRP13569 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CFTRP13569 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
CFTRP13569 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
CFTRP13569 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
CFTRP13569 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CFTRP13569 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
CFTRP13569 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
CFTRP13569 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CFTRP13569 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CFTRP13569 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
CFTRP13569 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
CFTRP13569 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CFTRP13569 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
CFTRP13569 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC45.19■■■■■ 4.82
CFTRP13569 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CFTRP13569 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
CFTRP13569 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CFTRP13569 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CFTRP13569 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
CFTRP13569 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CFTRP13569 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CFTRP13569 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
CFTRP13569 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CFTRP13569 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CFTRP13569 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CFTRP13569 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CFTRP13569 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CFTRP13569 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CFTRP13569 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
CFTRP13569 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
CFTRP13569 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
CFTRP13569 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CFTRP13569 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CFTRP13569 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CFTRP13569 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CFTRP13569 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
CFTRP13569 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
CFTRP13569 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
CFTRP13569 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CFTRP13569 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CFTRP13569 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CFTRP13569 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CFTRP13569 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CFTRP13569 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
CFTRP13569 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CFTRP13569 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
CFTRP13569 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CFTRP13569 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CFTRP13569 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
CFTRP13569 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
CFTRP13569 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
CFTRP13569 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CFTRP13569 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
CFTRP13569 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CFTRP13569 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
CFTRP13569 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CFTRP13569 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CFTRP13569 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CFTRP13569 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CFTRP13569 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
CFTRP13569 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
CFTRP13569 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CFTRP13569 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CFTRP13569 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.92■■■■■ 4.78
CFTRP13569 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
CFTRP13569 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
CFTRP13569 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
CFTRP13569 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CFTRP13569 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CFTRP13569 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CFTRP13569 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CFTRP13569 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CFTRP13569 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CFTRP13569 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
CFTRP13569 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CFTRP13569 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
CFTRP13569 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CFTRP13569 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms