Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK4P11802 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK4P11802 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK4P11802 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK4P11802 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK4P11802 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK4P11802 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK4P11802 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK4P11802 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK4P11802 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK4P11802 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK4P11802 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK4P11802 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK4P11802 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK4P11802 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK4P11802 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK4P11802 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK4P11802 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK4P11802 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK4P11802 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK4P11802 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK4P11802 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK4P11802 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK4P11802 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK4P11802 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK4P11802 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK4P11802 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK4P11802 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK4P11802 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK4P11802 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK4P11802 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK4P11802 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK4P11802 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK4P11802 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK4P11802 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK4P11802 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK4P11802 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK4P11802 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK4P11802 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK4P11802 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK4P11802 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK4P11802 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK4P11802 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK4P11802 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK4P11802 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK4P11802 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK4P11802 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK4P11802 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK4P11802 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK4P11802 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK4P11802 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK4P11802 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK4P11802 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK4P11802 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK4P11802 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK4P11802 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK4P11802 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK4P11802 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK4P11802 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK4P11802 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK4P11802 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK4P11802 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK4P11802 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK4P11802 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK4P11802 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK4P11802 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK4P11802 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK4P11802 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK4P11802 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK4P11802 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK4P11802 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK4P11802 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK4P11802 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK4P11802 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK4P11802 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK4P11802 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK4P11802 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK4P11802 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK4P11802 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK4P11802 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK4P11802 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK4P11802 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDK4P11802 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK4P11802 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK4P11802 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK4P11802 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK4P11802 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK4P11802 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK4P11802 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK4P11802 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK4P11802 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK4P11802 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK4P11802 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK4P11802 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK4P11802 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK4P11802 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK4P11802 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK4P11802 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK4P11802 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDK4P11802 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms