Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD28P10747 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD28P10747 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD28P10747 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD28P10747 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD28P10747 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD28P10747 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD28P10747 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD28P10747 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD28P10747 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD28P10747 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD28P10747 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD28P10747 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD28P10747 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD28P10747 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD28P10747 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD28P10747 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD28P10747 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD28P10747 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD28P10747 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD28P10747 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD28P10747 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD28P10747 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD28P10747 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD28P10747 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD28P10747 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD28P10747 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD28P10747 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD28P10747 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD28P10747 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CD28P10747 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CD28P10747 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD28P10747 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD28P10747 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CD28P10747 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD28P10747 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CD28P10747 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CD28P10747 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD28P10747 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD28P10747 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD28P10747 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD28P10747 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD28P10747 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD28P10747 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD28P10747 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD28P10747 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CD28P10747 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD28P10747 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD28P10747 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD28P10747 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD28P10747 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD28P10747 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD28P10747 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD28P10747 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD28P10747 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD28P10747 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD28P10747 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD28P10747 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD28P10747 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD28P10747 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD28P10747 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD28P10747 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD28P10747 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD28P10747 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD28P10747 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD28P10747 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD28P10747 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD28P10747 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD28P10747 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD28P10747 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD28P10747 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD28P10747 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD28P10747 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD28P10747 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD28P10747 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD28P10747 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD28P10747 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD28P10747 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD28P10747 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CD28P10747 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD28P10747 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD28P10747 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CD28P10747 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CD28P10747 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms