Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P0DMU3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P0DMU3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P0DMU3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P0DMU3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P0DMU3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P0DMU3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P0DMU3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P0DMU3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P0DMU3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P0DMU3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P0DMU3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P0DMU3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P0DMU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0DMU3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0DMU3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0DMU3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P0DMU3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P0DMU3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
P0DMU3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P0DMU3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0DMU3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0DMU3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P0DMU3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0DMU3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P0DMU3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0DMU3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0DMU3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0DMU3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P0DMU3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0DMU3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P0DMU3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0DMU3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0DMU3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0DMU3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P0DMU3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0DMU3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0DMU3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0DMU3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0DMU3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P0DMU3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P0DMU3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P0DMU3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0DMU3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0DMU3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0DMU3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0DMU3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P0DMU3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0DMU3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0DMU3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P0DMU3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0DMU3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P0DMU3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0DMU3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0DMU3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0DMU3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P0DMU3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0DMU3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0DMU3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0DMU3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0DMU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0DMU3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P0DMU3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0DMU3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0DMU3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0DMU3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P0DMU3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0DMU3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P0DMU3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0DMU3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0DMU3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0DMU3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0DMU3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
P0DMU3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P0DMU3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0DMU3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0DMU3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0DMU3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0DMU3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0DMU3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0DMU3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P0DMU3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P0DMU3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P0DMU3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P0DMU3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P0DMU3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P0DMU3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P0DMU3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P0DMU3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P0DMU3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P0DMU3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms