Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PATE4P0C8F1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PATE4P0C8F1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PATE4P0C8F1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PATE4P0C8F1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATE4P0C8F1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms