Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PFKMP08237 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PFKMP08237 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PFKMP08237 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PFKMP08237 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PFKMP08237 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PFKMP08237 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PFKMP08237 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PFKMP08237 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PFKMP08237 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PFKMP08237 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PFKMP08237 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PFKMP08237 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PFKMP08237 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PFKMP08237 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PFKMP08237 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PFKMP08237 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PFKMP08237 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PFKMP08237 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PFKMP08237 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PFKMP08237 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PFKMP08237 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PFKMP08237 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PFKMP08237 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PFKMP08237 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PFKMP08237 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PFKMP08237 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PFKMP08237 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKMP08237 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKMP08237 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKMP08237 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PFKMP08237 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PFKMP08237 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PFKMP08237 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PFKMP08237 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PFKMP08237 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PFKMP08237 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PFKMP08237 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PFKMP08237 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PFKMP08237 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PFKMP08237 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKMP08237 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKMP08237 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKMP08237 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKMP08237 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PFKMP08237 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PFKMP08237 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKMP08237 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PFKMP08237 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PFKMP08237 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKMP08237 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKMP08237 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKMP08237 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKMP08237 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKMP08237 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKMP08237 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PFKMP08237 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKMP08237 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKMP08237 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKMP08237 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PFKMP08237 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PFKMP08237 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PFKMP08237 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKMP08237 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKMP08237 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKMP08237 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKMP08237 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKMP08237 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKMP08237 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKMP08237 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKMP08237 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKMP08237 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKMP08237 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKMP08237 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKMP08237 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKMP08237 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKMP08237 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKMP08237 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKMP08237 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKMP08237 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PFKMP08237 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKMP08237 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKMP08237 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKMP08237 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKMP08237 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PFKMP08237 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PFKMP08237 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PFKMP08237 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PFKMP08237 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKMP08237 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKMP08237 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PFKMP08237 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms