Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCB1P08183 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCB1P08183 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABCB1P08183 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB1P08183 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms