Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN1P07384 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN1P07384 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPN1P07384 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN1P07384 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN1P07384 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN1P07384 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN1P07384 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms