Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLK3P07288 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLK3P07288 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KLK3P07288 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLK3P07288 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLK3P07288 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLK3P07288 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLK3P07288 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLK3P07288 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLK3P07288 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLK3P07288 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLK3P07288 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLK3P07288 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLK3P07288 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLK3P07288 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLK3P07288 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLK3P07288 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLK3P07288 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLK3P07288 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLK3P07288 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLK3P07288 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLK3P07288 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLK3P07288 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLK3P07288 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLK3P07288 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLK3P07288 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLK3P07288 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLK3P07288 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLK3P07288 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLK3P07288 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLK3P07288 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLK3P07288 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLK3P07288 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLK3P07288 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLK3P07288 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLK3P07288 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLK3P07288 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLK3P07288 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLK3P07288 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLK3P07288 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLK3P07288 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLK3P07288 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLK3P07288 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLK3P07288 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLK3P07288 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLK3P07288 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLK3P07288 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLK3P07288 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLK3P07288 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLK3P07288 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLK3P07288 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLK3P07288 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLK3P07288 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLK3P07288 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLK3P07288 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLK3P07288 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLK3P07288 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLK3P07288 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLK3P07288 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLK3P07288 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLK3P07288 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLK3P07288 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLK3P07288 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLK3P07288 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLK3P07288 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLK3P07288 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLK3P07288 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLK3P07288 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLK3P07288 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLK3P07288 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLK3P07288 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLK3P07288 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLK3P07288 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLK3P07288 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLK3P07288 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLK3P07288 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLK3P07288 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLK3P07288 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KLK3P07288 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLK3P07288 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLK3P07288 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLK3P07288 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLK3P07288 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLK3P07288 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLK3P07288 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLK3P07288 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLK3P07288 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLK3P07288 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLK3P07288 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLK3P07288 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLK3P07288 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLK3P07288 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms